/manager/の中にhtaccessのサンプルが入っていますが、URLのリライト(wwwアリを無しにする等)をmanagerにアクセスした際はオフにする設定になってます。
不用意に有効にすると、表題の内容だけではなく、設定を変更したらログイン前に飛ばされるとか、色々と問題がでることがあります。
ご注意ください。